网站安全出现问题首先是网站本身的系统程序编写漏洞，其次就是服务器配置问题。实事求是的说，系统也是软件也是由一堆代码组成，既然是人编写的程序代码就一定存在各种各样的漏洞。更何况，很多公司网站的服务器一直都是裸奔，最基础的防火墙、杀毒软件等都没有安装。网站的服务器配置绝对是一项技术活，其配置规则是满足网站运行的基本规则即可，能屏蔽的端口尽量屏蔽，能不安装的软件尽量不要安装。同时，需确保服务器操作系统及时更新，定期对网站数据进行备份，并进行病毒的扫描查杀工作。一般而言，Lunix系统相对于Windows系统的服务器要更为安全一些，如果技术力量满足建议为网站选配Lunix服务器。
网站内容安全涉及两方面，一个是由于网站系统漏洞或者网站主机漏洞被黑客利用，网站内容被恶意篡改，网站上出现非法内容;另一个是网站管理不善，对内容审核审计不严格，导致不合时宜的内容发布到网站上面。无论何种原因导致，网站上出现非法内容总不是一件好事，所以网站内容安全非常重要。其实无论是哪种原因造成，非法内容最终还是通过网站呈现而来。这就要求网站维护认为，定期对网站内容进行监测。对于内容庞杂且访问量比较大的网站，引航博景(www.joyweb.cn)建议通过程序设置敏感关键词屏蔽及警报系统，这样一旦发现非法信息就可以快速发现并及时响应处理。现在很多第三方网站防篡改系统已经做的非常完善，如有必要建议接入到网站，让网站内容安全得到必要保障。
网站被黑客入侵内容遭遇篡改等，其大部分原因都是网站本身程序编写不严谨导致。网站建设是一个入门偏低的行业，从业者众多用户在制作网站的时候，也有很多选择空间。也正是这样众多的网站建设公司，带来了网站技术和网站安全标准混乱的状态。相对而言，规模大一些的技术力量强悍一些的公司，网站系统安全处理的相对较好。而小的网站建设公司多半采用购买或者使用开源的CMS系统，即便很多公司会对开源的系统做一些修改，但是根本的逻辑仍旧相同。而开源网站系统的最大弊端就是源码公开，给用户带来方便的同时，也吸引无数黑产人员琢磨分析，给网站带来诸多风险隐患。笔者前文《开源的网站制作系统绝非企业网站建设理想选择》有详细讨论过这个问题，建议公司在设计制作网站的时候，选择有一定实力的公司进行闭源定制开发。